劇場版動畫《來自深淵 覺醒的神秘》（メイドインアビス 目覚める神秘）已於 10 月 23 日在日本地區上映。第二彈「詛咒船隊」主視覺已正式公開。另外，官方宣布確定製作接續《來自深淵 覺醒的神秘》的第二彈劇場版動畫。
本作劇情接續「烈日的黃金鄉」，莉可一行人來到深界六層不歸之都前進，在那裡有座「慘劇終末的村子」，那是擁有自己一套價值觀的慘劇終末們所生活的地方，而他們的公主法普妲也生活在那裡。
隨著法普妲實現了「願望」，村莊獲得解放卻也隨之崩壞，莉可一行人邀請法普妲加入旅途，繼續朝著深界七層邁進。在深界六層底部，他們邂逅了由史錸喬率領的「詛咒船隊」。
詛咒船隊的聲優陣容如下：
- 史錸喬：水樹奈奈
- 亞塔拉馬爾：武內駿輔
- 尼夏可拉：渡邊明乃
- 楔爾米：東山奈央
- 梅納耶：宮本侑芽
- 媞帕絲特：諸星堇
台灣方面，劇場版《來自深淵 覺醒的神秘》將於 2026 年 11 月 20 日上映。
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